| 20. Jornada | 19.01.2025 | Mérida AD | - | Marbella FC | 4:2 |  |
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| 21. Jornada | 26.01.2025 | UD Ibiza | - | Mérida AD | 3:0 | |
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| 22. Jornada | 01.02.2025 | Betis B | - | Mérida AD | 0:4 | ||||
| 23. Jornada | 08.02.2025 | Mérida AD | - | Alcorcón | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 15.02.2025 | CF Intercity | - | Mérida AD | 3:1 | |
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| 25. Jornada | 23.02.2025 | Mérida AD | - | Real Murcia | 1:4 | ||||
| 26. Jornada | 01.03.2025 | Algeciras CF | - | Mérida AD | 1:1 | |
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| 27. Jornada | 08.03.2025 | Mérida AD | - | Atlético Sanluqueño CF | 3:2 | ||||
| 28. Jornada | 14.03.2025 | Villarreal B | - | Mérida AD | 3:0 | |
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| 30. Jornada | 30.03.2025 | CD Alcoyano | - | Mérida AD | 2:3 | ||||
| 31. Jornada | 06.04.2025 | Mérida AD | - | Sevilla Atlético | 2:1 | ||||
| 32. Jornada | 13.04.2025 | Hércules CF | - | Mérida AD | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 20.04.2025 | CF Fuenlabrada | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 34. Jornada | 27.04.2025 | Mérida AD | - | Antequera CF | 3:0 | ||||
| 35. Jornada | 03.05.2025 | AD Ceuta FC | - | Mérida AD | 1:0 | ||||
| 36. Jornada | 10.05.2025 | Mérida AD | - | Real Madrid Castilla | 0:0 | |
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| 37. Jornada | 17.05.2025 | RC Recreativo | - | Mérida AD | 0:1 |
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