| 1. Jornada | 20.08.2016 | Arenas de Getxo | - | CF Fuenlabrada | 2:1 | ||||
| 2. Jornada | 28.08.2016 | CF Fuenlabrada | - | UD Logroñés | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 04.09.2016 | UD SS Reyes | - | CF Fuenlabrada | 5:1 | ||||
| 7. Jornada | 01.10.2016 | Real Sociedad B | - | CF Fuenlabrada | 1:2 |  |
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| 8. Jornada | 09.10.2016 | CF Fuenlabrada | - | Real Unión | 1:0 | ||||
| 10. Jornada | 23.10.2016 | CF Fuenlabrada | - | SD Gernika | 4:2 |  |
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| 13. Jornada | 06.11.2016 | CF Fuenlabrada | - | Rayo Majadahonda | 3:2 | ||||
| 14. Jornada | 13.11.2016 | CD Toledo | - | CF Fuenlabrada | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 27.11.2016 | SD Zamudio | - | CF Fuenlabrada | 4:2 | ||||
| 18. Jornada | 11.12.2016 | Barakaldo CF | - | CF Fuenlabrada | 1:1 |
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