| 5. Jornada | 18.09.2016 | Extremadura UD | - | Linares Deportivo | 1:2 | ||||
| 6. Jornada | 25.09.2016 | Córdoba B | - | Extremadura UD | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 02.10.2016 | Extremadura UD | - | Atlético Mancha Real | 0:3 | ||||
| 10. Jornada | 23.10.2016 | Mérida AD | - | Extremadura UD | 5:1 | ||||
| 11. Jornada | 29.10.2016 | Extremadura UD | - | Lorca FC | 0:3 | ||||
| 12. Jornada | 02.11.2016 | UD Melilla | - | Extremadura UD | 0:1 |  |
|||
| 13. Jornada | 06.11.2016 | Extremadura UD | - | Granada B | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 13.11.2016 | San Fernando CD | - | Extremadura UD | 1:3 | |
|||
| 15. Jornada | 20.11.2016 | Extremadura UD | - | FC Cartagena | 0:2 | ||||
| 16. Jornada | 27.11.2016 | Marbella FC | - | Extremadura UD | 3:2 | ||||
| 17. Jornada | 04.12.2016 | Extremadura UD | - | Real Jaén | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 11.12.2016 | Atlético Sanluqueño CF | - | Extremadura UD | 3:0 |
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