| 29. Jornada | 05.03.2000 | UE Lleida | - | Atlético B | 3:0 | ||||
| 30. Jornada | 11.03.2000 | Atlético B | - | UD Salamanca | 2:1 |  |
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| 31. Jornada | 19.03.2000 | Albacete | - | Atlético B | 1:0 | ||||
| 32. Jornada | 26.03.2000 | Atlético B | - | CD Badajoz | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 01.04.2000 | Getafe | - | Atlético B | 2:0 | ||||
| 34. Jornada | 09.04.2000 | Atlético B | - | Eibar | 2:0 | ||||
| 35. Jornada | 16.04.2000 | Elche | - | Atlético B | 1:1 | ||||
| 36. Jornada | 23.04.2000 | Atlético B | - | Villarreal | 1:4 |  |
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| 37. Jornada | 29.04.2000 | Levante | - | Atlético B | 3:0 | |
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| 40. Jornada | 21.05.2000 | Atlético B | - | RC Recreativo | 1:0 | |
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| 41. Jornada | 28.05.2000 | CD Toledo | - | Atlético B | 1:1 | ||||
| 42. Jornada | 04.06.2000 | Atlético B | - | CP Mérida | 0:0 | |
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