| 2. Jornada | 28.08.2016 | CF Fuenlabrada | - | UD Logroñés | 2:1 |  |
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| 3. Jornada | 04.09.2016 | UD Logroñés | - | Rayo Majadahonda | 1:0 | |
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| 4. Jornada | 11.09.2016 | CD Toledo | - | UD Logroñés | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 18.09.2016 | UD Logroñés | - | UD Socuéllamos | 2:0 | ||||
| 6. Jornada | 24.09.2016 | SD Zamudio | - | UD Logroñés | 2:0 | ||||
| 7. Jornada | 02.10.2016 | UD Logroñés | - | Bilbao Athletic | 5:3 | ||||
| 8. Jornada | 09.10.2016 | Barakaldo CF | - | UD Logroñés | 0:0 | ||||
| 21. Jornada | 15.01.2017 | UD Logroñés | - | CF Fuenlabrada | 1:1 | ||||
| 22. Jornada | 22.01.2017 | Rayo Majadahonda | - | UD Logroñés | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 29.01.2017 | UD Logroñés | - | CD Toledo | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 05.02.2017 | UD Socuéllamos | - | UD Logroñés | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 12.02.2017 | UD Logroñés | - | SD Zamudio | 1:1 | ||||
| 26. Jornada | 19.02.2017 | Bilbao Athletic | - | UD Logroñés | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 26.02.2017 | UD Logroñés | - | Barakaldo CF | 0:1 | ||||
| 29. Jornada | 12.03.2017 | UD Logroñés | - | Arenas de Getxo | 0:0 | ||||
| 30. Jornada | 19.03.2017 | UD Logroñés | - | Albacete | 3:4 | |
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| 32. Jornada | 02.04.2017 | UD Logroñés | - | CDA Navalcarnero | 4:0 |
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