| 26. Jornada | 13.02.2000 | CP Mérida | - | Las Palmas | 3:0 |  |
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| 27. Jornada | 20.02.2000 | CD Logroñés | - | CP Mérida | 1:2 | ||||
| 28. Jornada | 27.02.2000 | CP Mérida | - | UE Lleida | 0:0 | ||||
| 29. Jornada | 05.03.2000 | UD Salamanca | - | CP Mérida | 0:0 | ||||
| 30. Jornada | 11.03.2000 | CP Mérida | - | Albacete | 1:1 | ||||
| 31. Jornada | 19.03.2000 | CD Badajoz | - | CP Mérida | 0:3 | ||||
| 32. Jornada | 26.03.2000 | CP Mérida | - | Getafe | 1:0 | ||||
| 33. Jornada | 02.04.2000 | Eibar | - | CP Mérida | 0:0 | |
|||
| 35. Jornada | 16.04.2000 | Villarreal | - | CP Mérida | 1:0 | ||||
| 37. Jornada | 30.04.2000 | Tenerife | - | CP Mérida | 0:1 | ||||
| 38. Jornada | 07.05.2000 | CP Mérida | - | Sporting | 1:0 | ||||
| 39. Jornada | 14.05.2000 | RC Recreativo | - | CP Mérida | 0:3 |
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