| 1. Jornada | 31.08.2008 | UD Salamanca | - | Alavés | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 07.09.2008 | Alavés | - | Córdoba | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 13.09.2008 | Rayo | - | Alavés | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 05.10.2008 | Alavés | - | Las Palmas | 2:1 | ||||
| 7. Jornada | 11.10.2008 | Zaragoza | - | Alavés | 4:2 | ||||
| 8. Jornada | 18.10.2008 | Alavés | - | Real Murcia | 4:1 |  |
|||
| 9. Jornada | 26.10.2008 | Hércules CF | - | Alavés | 3:0 | ||||
| 10. Jornada | 02.11.2008 | Alavés | - | Elche | 0:3 | ||||
| 11. Jornada | 09.11.2008 | Alavés | - | Sevilla Atlético | 2:2 |  |
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| 12. Jornada | 16.11.2008 | Xerez CD | - | Alavés | 5:0 | ||||
| 14. Jornada | 30.11.2008 | CD Castellón | - | Alavés | 0:1 | |
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| 15. Jornada | 06.12.2008 | Alavés | - | Gimnàstic de Tarragona | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 14.12.2008 | Eibar | - | Alavés | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 21.12.2008 | Alavés | - | Tenerife | 1:2 |
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