| 1. Jornada | 25.08.2024 | Mérida AD | - | RC Recreativo | 3:3 | ||||
| 2. Jornada | 01.09.2024 | Atlético Sanluqueño CF | - | Mérida AD | 0:3 | ||||
| 8. Jornada | 12.10.2024 | Antequera CF | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 9. Jornada | 20.10.2024 | Mérida AD | - | Betis B | 1:1 | ||||
| 10. Jornada | 27.10.2024 | Mérida AD | - | CD Alcoyano | 2:2 | ||||
| 19. Jornada | 10.01.2025 | Sevilla Atlético | - | Mérida AD | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 15.02.2025 | CF Intercity | - | Mérida AD | 3:1 | ||||
| 25. Jornada | 23.02.2025 | Mérida AD | - | Real Murcia | 1:4 | ||||
| 26. Jornada | 01.03.2025 | Algeciras CF | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 08.03.2025 | Mérida AD | - | Atlético Sanluqueño CF | 3:2 | ||||
| 28. Jornada | 14.03.2025 | Villarreal B | - | Mérida AD | 3:0 | ||||
| 29. Jornada | 21.03.2025 | Mérida AD | - | Yeclano Deportivo | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 30.03.2025 | CD Alcoyano | - | Mérida AD | 2:3 |  |
|||
| 31. Jornada | 06.04.2025 | Mérida AD | - | Sevilla Atlético | 2:1 | ||||
| 32. Jornada | 13.04.2025 | Hércules CF | - | Mérida AD | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 20.04.2025 | CF Fuenlabrada | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 34. Jornada | 27.04.2025 | Mérida AD | - | Antequera CF | 3:0 | ||||
| 36. Jornada | 10.05.2025 | Mérida AD | - | Real Madrid Castilla | 0:0 | |
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