| 3. Jornada | 13.09.2008 | Rayo | - | Alavés | 2:1 | ||||
| 4. Jornada | 20.09.2008 | Sevilla Atlético | - | Rayo | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 12.10.2008 | Rayo | - | CD Castellón | 4:2 |  |
|||
| 8. Jornada | 19.10.2008 | Gimnàstic de Tarragona | - | Rayo | 3:1 | ||||
| 9. Jornada | 25.10.2008 | Rayo | - | Eibar | 4:1 | ||||
| 10. Jornada | 02.11.2008 | Tenerife | - | Rayo | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 16.11.2008 | Celta | - | Rayo | 0:0 | ||||
| 14. Jornada | 29.11.2008 | Albacete | - | Rayo | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 06.12.2008 | Rayo | - | UD Salamanca | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 20.12.2008 | Elche | - | Rayo | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 04.01.2009 | Rayo | - | Levante | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 07.03.2009 | Rayo | - | Girona | 1:1 | ||||
| 33. Jornada | 18.04.2009 | Rayo | - | Celta | 4:1 | ||||
| 37. Jornada | 16.05.2009 | Rayo | - | Córdoba | 5:0 | |
|||
| 41. Jornada | 13.06.2009 | Las Palmas | - | Rayo | 0:0 |
España