| 1. Jornada | 27.08.2006 | Alavés | - | Elche | 1:1 |  |
|||
| 2. Jornada | 03.09.2006 | Málaga | - | Alavés | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 09.09.2006 | Alavés | - | Real Madrid Castilla | 3:1 | ||||
| 5. Jornada | 23.09.2006 | Alavés | - | Tenerife | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 08.10.2006 | Alavés | - | Almería | 1:0 | ||||
| 8. Jornada | 15.10.2006 | Cádiz CF | - | Alavés | 1:1 | ||||
| 9. Jornada | 21.10.2006 | Alavés | - | CD Castellón | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 21.12.2006 | Alavés | - | Xerez CD | 1:0 | ||||
| 19. Jornada | 07.01.2007 | Valladolid | - | Alavés | 1:0 | ||||
| 20. Jornada | 13.01.2007 | Alavés | - | Lorca Deportiva | 3:1 | |
|||
| 21. Jornada | 21.01.2007 | Ponferradina | - | Alavés | 0:2 | |
|||
| 22. Jornada | 28.01.2007 | Elche | - | Alavés | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 03.02.2007 | Alavés | - | Málaga | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 10.02.2007 | Real Madrid Castilla | - | Alavés | 1:1 | ||||
| 26. Jornada | 24.02.2007 | Tenerife | - | Alavés | 1:2 | ||||
| 29. Jornada | 18.03.2007 | Alavés | - | Cádiz CF | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 25.03.2007 | CD Castellón | - | Alavés | 2:0 | ||||
| 31. Jornada | 01.04.2007 | Alavés | - | Hércules CF | 2:3 | |
|||
| 34. Jornada | 22.04.2007 | Alavés | - | Numancia | 2:2 | ||||
| 37. Jornada | 12.05.2007 | Ciudad de Murcia | - | Alavés | 5:1 |
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