| 23. Jornada | 23.01.2000 | CD Badajoz | - | Eibar | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 30.01.2000 | Elche | - | CD Badajoz | 0:0 | ||||
| 25. Jornada | 06.02.2000 | CD Badajoz | - | Villarreal | 1:1 | ||||
| 26. Jornada | 12.02.2000 | Levante | - | CD Badajoz | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 20.02.2000 | CD Badajoz | - | Tenerife | 0:2 | ||||
| 28. Jornada | 26.02.2000 | Sporting | - | CD Badajoz | 0:0 |  |
|||
| 30. Jornada | 12.03.2000 | CD Toledo | - | CD Badajoz | 2:0 | ||||
| 31. Jornada | 19.03.2000 | CD Badajoz | - | CP Mérida | 0:3 | |
|||
| 32. Jornada | 26.03.2000 | Atlético B | - | CD Badajoz | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 02.04.2000 | CD Badajoz | - | Leganés | 1:1 | |
|||
| 34. Jornada | 09.04.2000 | Osasuna | - | CD Badajoz | 0:0 | |
|||
| 35. Jornada | 16.04.2000 | CD Badajoz | - | SD Compostela | 2:2 | |
|||
| 36. Jornada | 22.04.2000 | Córdoba | - | CD Badajoz | 0:4 |  |
|||
| 37. Jornada | 29.04.2000 | CD Badajoz | - | Las Palmas | 0:2 | ||||
| 38. Jornada | 07.05.2000 | CD Logroñés | - | CD Badajoz | 2:0 | ||||
| 39. Jornada | 14.05.2000 | CD Badajoz | - | UE Lleida | 0:0 | ||||
| 40. Jornada | 21.05.2000 | UD Salamanca | - | CD Badajoz | 2:2 | ||||
| 41. Jornada | 27.05.2000 | CD Badajoz | - | Albacete | 1:2 | ||||
| 42. Jornada | 04.06.2000 | CF Extremadura | - | CD Badajoz | 2:2 | |
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