| Primera etapa | 01.12.1999 | Leganés | - | Villarreal | 0:3 pró. | ||||
| Segunda etapa | 14.12.1999 | Barakaldo CF | - | Villarreal | 0:0 |  |
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| Segunda etapa | 11.01.2000 | Villarreal | - | Barakaldo CF | 1:0 | ||||
| Octavos de final | 19.01.2000 | SD Compostela | - | Villarreal | 3:0 | ||||
| Octavos de final | 01.02.2000 | Villarreal | - | SD Compostela | 2:4 pn. |
España