| 1. Jornada | 18.08.2012 | Lugo | - | Hércules CF | 1:0 | ||||
| 2. Jornada | 26.08.2012 | Hércules CF | - | Elche | 1:2 |  |
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| 3. Jornada | 02.09.2012 | Alcorcón | - | Hércules CF | 1:0 | |
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| 4. Jornada | 08.09.2012 | Hércules CF | - | Girona | 2:1 | |
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| 5. Jornada | 16.09.2012 | Villarreal | - | Hércules CF | 1:0 | |
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| 6. Jornada | 22.09.2012 | Hércules CF | - | Barcelona B | 0:3 | ||||
| 7. Jornada | 30.09.2012 | Almería | - | Hércules CF | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 08.10.2012 | Hércules CF | - | Real Madrid Castilla | 2:4 |  |
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| 10. Jornada | 20.10.2012 | Hércules CF | - | CD Guadalajara | 0:0 | |
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| 13. Jornada | 11.11.2012 | Hércules CF | - | Las Palmas | 0:2 | ||||
| 14. Jornada | 18.11.2012 | Córdoba | - | Hércules CF | 1:2 | ||||
| 15. Jornada | 24.11.2012 | Hércules CF | - | Sporting | 1:1 | |
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| 16. Jornada | 02.12.2012 | Huesca | - | Hércules CF | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 09.12.2012 | Hércules CF | - | RC Recreativo | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 16.12.2012 | Mirandés | - | Hércules CF | 3:2 | ||||
| 19. Jornada | 22.12.2012 | Hércules CF | - | Numancia | 1:3 | ||||
| 20. Jornada | 06.01.2013 | Real Murcia | - | Hércules CF | 2:1 |  |
|||
| 23. Jornada | 26.01.2013 | Elche | - | Hércules CF | 2:0 |
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