| 1. Jornada | 29.07.2005 | Werder Bremen II | - | FC St. Pauli | 0:1 |  |
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| 2. Jornada | 03.08.2005 | FC St. Pauli | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 06.08.2005 | Kickers Emden | - | FC St. Pauli | 0:4 |  |
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| 4. Jornada | 13.08.2005 | FC St. Pauli | - | VfB Lübeck | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 23.08.2005 | Fortuna Düsseldorf | - | FC St. Pauli | 2:0 |  |
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| 7. Jornada | 03.09.2005 | Wuppertaler SV | - | FC St. Pauli | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 10.09.2005 | FC St. Pauli | - | Bayer Leverkusen II | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 17.09.2005 | Hertha II | - | FC St. Pauli | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 20.09.2005 | FC St. Pauli | - | Preußen Münster | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 24.09.2005 | Chemnitzer FC | - | FC St. Pauli | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 01.10.2005 | FC St. Pauli | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:2 | ||||
| 38. Jornada | 27.05.2006 | FC St. Pauli | - | Hamburgo II | 1:1 |
Alemania