| 20. Jornada | 06.12.2005 | Barnsley FC | - | Tranmere Rovers | 2:1 | ||||
| 21. Jornada | 10.12.2005 | Blackpool FC | - | Tranmere Rovers | 1:1 |  |
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| 22. Jornada | 17.12.2005 | Tranmere Rovers | - | Brentford FC | 1:4 | |
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| 23. Jornada | 26.12.2005 | Walsall FC | - | Tranmere Rovers | 0:0 | ||||
| 24. Jornada | 28.12.2005 | Tranmere Rovers | - | Yeovil Town | 4:1 | ||||
| 25. Jornada | 31.12.2005 | Port Vale FC | - | Tranmere Rovers | 0:2 | |
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| 40. Jornada | 31.03.2006 | Tranmere Rovers | - | Port Vale FC | 3:0 | ||||
| 41. Jornada | 08.04.2006 | Rotherham United | - | Tranmere Rovers | 2:0 | ||||
| 42. Jornada | 15.04.2006 | Tranmere Rovers | - | Nottingham Forest | 0:1 | ||||
| 43. Jornada | 17.04.2006 | Colchester United | - | Tranmere Rovers | 1:0 | ||||
| 45. Jornada | 29.04.2006 | Milton Keynes Dons | - | Tranmere Rovers | 1:2 | ||||
| 46. Jornada | 06.05.2006 | Tranmere Rovers | - | Doncaster Rovers | 0:2 |
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