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| I | UE Lleida | - | Águilas CF | 3:0 | ||
| V | Águilas CF | - | UE Lleida | 1:1 | ||
| I: 01.09.1998 | V: 08.09.1998 | Campeones: UE Lleida | ||||
| I | CyD Leonesa | - | Numancia | 2:2 | ||
| V | Numancia | - | CyD Leonesa | 1:1 | ||
| I: 01.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Numancia | ||||
| I | Algeciras CF | - | RC Recreativo | 1:0 | ||
| V | RC Recreativo | - | Algeciras CF | 3:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: RC Recreativo | ||||
| I | Real Jaén | - | Sevilla | 1:1 | ||
| V | Sevilla | - | Real Jaén | 2:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Sevilla | ||||
| I | Universidad Las Palmas | - | SD Compostela | 1:1 | ||
| V | SD Compostela | - | Universidad Las Palmas | 2:1 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: SD Compostela | ||||
| I | CD Lalín | - | Las Palmas | 1:0 | ||
| V | Las Palmas | - | CD Lalín | 4:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Las Palmas | ||||
| I | Jerez CF | - | Rayo | 2:2 | ||
| V | Rayo | - | Jerez CF | 1:2 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 08.09.1998 | Campeones: Jerez CF | ||||
| I | UD SS Reyes | - | CP Mérida | 1:0 | ||
| V | CP Mérida | - | UD SS Reyes | 2:1 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: UD SS Reyes | ||||
| I | Elche | - | Hércules CF | 1:0 | ||
| V | Hércules CF | - | Elche | 1:1 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Elche | ||||
| I | Terrassa FC | - | Levante | 1:1 | ||
| V | Levante | - | Terrassa FC | 3:1 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Levante | ||||
| I | CD Lealtad | - | Sporting | 2:1 | ||
| V | Sporting | - | CD Lealtad | 3:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Sporting | ||||
| I | SD Noja | - | Osasuna | 0:1 | ||
| V | Osasuna | - | SD Noja | 3:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Osasuna | ||||
| I | SD Beasain | - | Eibar | 0:0 | ||
| V | Eibar | - | SD Beasain | 1:1 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: SD Beasain | ||||
| I | CD Móstoles | - | CD Badajoz | 1:2 | ||
| V | CD Badajoz | - | CD Móstoles | 2:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: CD Badajoz | ||||
| I | Cádiz CF | - | Granada | 2:2 | ||
| V | Granada | - | Cádiz CF | 1:2 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Cádiz CF | ||||
| I | Xerez CD | - | Málaga | 2:1 | ||
| V | Málaga | - | Xerez CD | 2:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Málaga | ||||
| I | UB Conquense | - | Albacete | 0:3 | ||
| V | Albacete | - | UB Conquense | 1:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Albacete | ||||
| I | Talavera CF | - | CD Toledo | 1:1 | ||
| V | CD Toledo | - | Talavera CF | 0:2 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Talavera CF | ||||
| I | CD Calahorra | - | CD Ourense | 1:1 | ||
| V | CD Ourense | - | CD Calahorra | 2:0 | ||
| I: 02.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: CD Ourense | ||||
| I | Palamós CF | - | Benidorm CD | 1:1 | ||
| V | Benidorm CD | - | Palamós CF | 3:1 | ||
| I: 03.09.1998 | V: 09.09.1998 | Campeones: Benidorm CD | ||||
