| 2. Jornada | 23.07.2016 | FC Koper | - | NK Aluminij | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 30.07.2016 | Rudar Velenje | - | FC Koper | 2:0 | ||||
| 4. Jornada | 06.08.2016 | FC Koper | - | NK Celje | 2:1 | ||||
| 5. Jornada | 13.08.2016 | NK Domžale | - | FC Koper | 2:0 |  |
|||
| 13. Jornada | 16.10.2016 | NK Celje | - | FC Koper | 1:1 | |
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| 14. Jornada | 22.10.2016 | FC Koper | - | NK Domžale | 1:3 | |
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| 15. Jornada | 30.10.2016 | NK Radomlje | - | FC Koper | 1:3 | |
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| 17. Jornada | 19.11.2016 | NK Krško | - | FC Koper | 0:0 | |
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| 18. Jornada | 26.11.2016 | FC Koper | - | ND Gorica | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 30.11.2016 | NK Maribor | - | FC Koper | 4:0 | |
|||
| 21. Jornada | 10.12.2016 | Rudar Velenje | - | FC Koper | 2:2 | ||||
| 22. Jornada | 26.02.2017 | FC Koper | - | NK Celje | 1:1 | ||||
| 23. Jornada | 04.03.2017 | NK Domžale | - | FC Koper | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 11.03.2017 | FC Koper | - | NK Radomlje | 4:1 | ||||
| 32. Jornada | 06.05.2017 | FC Koper | - | NK Domžale | 3:0 | |
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