| 1. Jornada | 29.08.1999 | Cosenza Calcio | - | Atalanta | 0:1 | ||||
| 2. Jornada | 05.09.1999 | Atalanta | - | Treviso FBC | 3:2 | ||||
| 3. Jornada | 12.09.1999 | Ravenna Calcio | - | Atalanta | 1:3 |  |
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| 4. Jornada | 20.09.1999 | Atalanta | - | Nápoles | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 26.09.1999 | Ternana Calcio | - | Atalanta | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 03.10.1999 | Atalanta | - | Pescara Calcio | 3:1 | ||||
| 8. Jornada | 24.10.1999 | Atalanta | - | AC Pistoiese | 3:1 | ||||
| 18. Jornada | 09.01.2000 | Atalanta | - | AC Savoia 1908 | 4:1 | ||||
| 19. Jornada | 16.01.2000 | AC Cesena | - | Atalanta | 1:1 | |
|||
| 20. Jornada | 23.01.2000 | Atalanta | - | Cosenza Calcio | 1:1 | ||||
| 21. Jornada | 30.01.2000 | Treviso FBC | - | Atalanta | 2:1 | |
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| 22. Jornada | 14.02.2000 | Atalanta | - | Ravenna Calcio | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 21.02.2000 | Nápoles | - | Atalanta | 1:0 | |
|||
| 25. Jornada | 03.03.2000 | Pescara Calcio | - | Atalanta | 0:1 | ||||
| 26. Jornada | 13.03.2000 | Atalanta | - | Sampdoria | 3:3 | ||||
| 29. Jornada | 02.04.2000 | Atalanta | - | Brescia Calcio | 1:1 | ||||
| 33. Jornada | 07.05.2000 | Chievo | - | Atalanta | 1:1 |
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