| 28. Jornada | 16.03.2013 | TSV 1860 Rosenheim | - | FC Ismaning | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 23.03.2013 | FC Ismaning | - | 1. FC Nürnberg II | 0:2 | ||||
| 30. Jornada | 30.03.2013 | TSV Buchbach | - | FC Ismaning | 1:1 | ||||
| 23. Jornada | 03.04.2013 | FC Ismaning | - | SV Heimstetten | 0:0 | ||||
| 31. Jornada | 07.04.2013 | FC Ismaning | - | VfL Frohnlach | 1:2 | ||||
| 32. Jornada | 13.04.2013 | Eintracht Bamberg | - | FC Ismaning | 3:0 | ||||
| 33. Jornada | 20.04.2013 | FC Ismaning | - | Bayern Múnich II | 1:3 | ||||
| 26. Jornada | 23.04.2013 | FC Memmingen | - | FC Ismaning | 2:0 | ||||
| 34. Jornada | 27.04.2013 | FC Ismaning | - | FV Illertissen | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 30.04.2013 | TSV 1860 München II | - | FC Ismaning | 2:1 | ||||
| 35. Jornada | 04.05.2013 | SpVgg Greuther Fürth II | - | FC Ismaning | 3:0 | ||||
| 36. Jornada | 11.05.2013 | FC Ismaning | - | Viktoria Aschaffenburg | 0:2 | ||||
| 37. Jornada | 18.05.2013 | TSV 1896 Rain | - | FC Ismaning | 2:0 | ||||
| 38. Jornada | 25.05.2013 | FC Ismaning | - | SV Seligenporten | 3:1 |  |
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