| 1. Jornada | 10.08.2007 | FC St. Pauli | - | Colonia | 0:2 | ||||
| 2. Jornada | 19.08.2007 | FC Carl Zeiss Jena | - | FC St. Pauli | 0:1 | ||||
| 3. Jornada | 26.08.2007 | FC St. Pauli | - | TuS Koblenz | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 02.09.2007 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
| 5. Jornada | 14.09.2007 | FC St. Pauli | - | Kickers Offenbach | 3:1 | ||||
| 6. Jornada | 21.09.2007 | TSV 1860 München | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
| 7. Jornada | 25.09.2007 | FC St. Pauli | - | Bor. Mönchengladbach | 0:3 |  |
|||
| 8. Jornada | 28.09.2007 | VfL Osnabrück | - | FC St. Pauli | 3:1 | ||||
| 11. Jornada | 26.10.2007 | FC St. Pauli | - | SV Wehen Wiesbaden | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 11.11.2007 | FC St. Pauli | - | Augsburgo | 2:0 |  |
|||
| 15. Jornada | 30.11.2007 | FC St. Pauli | - | 1. FC Kaiserslautern | 3:4 | ||||
| 16. Jornada | 07.12.2007 | Alemannia Aachen | - | FC St. Pauli | 2:2 | ||||
| 20. Jornada | 15.02.2008 | TuS Koblenz | - | FC St. Pauli | 1:1 | ||||
| 22. Jornada | 02.03.2008 | Kickers Offenbach | - | FC St. Pauli | 4:3 | |
|||
| 23. Jornada | 10.03.2008 | FC St. Pauli | - | TSV 1860 München | 0:0 |  |
|||
| 28. Jornada | 11.04.2008 | SV Wehen Wiesbaden | - | FC St. Pauli | 1:3 | ||||
| 34. Jornada | 18.05.2008 | Mainz | - | FC St. Pauli | 5:1 | |
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