| 18. Jornada | 04.03.2007 | VFC Plauen | - | FC Carl Zeiss Jena II | 0:1 | ||||
| 20. Jornada | 17.03.2007 | FC Carl Zeiss Jena II | - | FSV Zwickau | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 07.04.2007 | FC Carl Zeiss Jena II | - | Chemnitzer FC | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 18.04.2007 | FC Carl Zeiss Jena II | - | Hallescher FC | 0:1 |  |
|||
| 24. Jornada | 22.04.2007 | SV Dessau 05 | - | FC Carl Zeiss Jena II | 0:1 | ||||
| 26. Jornada | 06.05.2007 | Germania Halberstadt | - | FC Carl Zeiss Jena II | 2:1 | ||||
| 29. Jornada | 20.05.2007 | Energie Cottbus II | - | FC Carl Zeiss Jena II | 3:2 |
Alemania