| 3. Jornada | 12.08.2006 | Werder Bremen II | - | Kickers Emden | 2:1 | ||||
| 4. Jornada | 19.08.2006 | FC St. Pauli | - | Werder Bremen II | 2:1 | ||||
| 22. Jornada | 17.02.2007 | Kickers Emden | - | Werder Bremen II | 4:2 |  |
|||
| 20. Jornada | 21.02.2007 | SV Wilhelmshaven | - | Werder Bremen II | 2:1 | ||||
| 21. Jornada | 28.02.2007 | Werder Bremen II | - | Bayer Leverkusen II | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 03.03.2007 | Hamburgo II | - | Werder Bremen II | 0:3 | ||||
| 27. Jornada | 24.03.2007 | Werder Bremen II | - | Rot Weiss Ahlen | 0:2 | ||||
| 29. Jornada | 31.03.2007 | Werder Bremen II | - | Fortuna Düsseldorf | 2:0 | ||||
| 30. Jornada | 07.04.2007 | Rot-Weiß Erfurt | - | Werder Bremen II | 1:1 |  |
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| 31. Jornada | 14.04.2007 | Werder Bremen II | - | Dynamo Dresden | 1:1 | ||||
| 32. Jornada | 20.04.2007 | 1. FC Magdeburg | - | Werder Bremen II | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 24.04.2007 | Werder Bremen II | - | FC St. Pauli | 0:2 | ||||
| 33. Jornada | 28.04.2007 | Werder Bremen II | - | Wuppertaler SV | 1:2 | ||||
| 38. Jornada | 02.06.2007 | Werder Bremen II | - | 1. FC Union Berlin | 3:2 | |
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