| 1. Jornada | 26.07.2024 | BFC Dynamo | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:3 | ||||
| 2. Jornada | 04.08.2024 | FC Carl Zeiss Jena | - | Hertha Zehlendorf | 6:2 | ||||
| 3. Jornada | 10.08.2024 | Greifswalder FC | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:3 |  |
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| 25. Jornada | 09.03.2025 | 1. FC Lok Leipzig | - | FC Carl Zeiss Jena | 3:0 | ||||
| 19. Jornada | 12.03.2025 | Hertha Zehlendorf | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:2 | |
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| 22. Jornada | 25.03.2025 | FC Carl Zeiss Jena | - | VFC Plauen | 2:1 | |
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| 27. Jornada | 28.03.2025 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | FC Carl Zeiss Jena | 4:2 | |
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| 28. Jornada | 04.04.2025 | FC Carl Zeiss Jena | - | Hallescher FC | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 08.04.2025 | Rot-Weiß Erfurt | - | FC Carl Zeiss Jena | 3:1 | ||||
| 29. Jornada | 13.04.2025 | Hertha II | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:4 | ||||
| 30. Jornada | 19.04.2025 | FC Carl Zeiss Jena | - | FSV Zwickau | 1:2 | ||||
| 32. Jornada | 06.05.2025 | SV Babelsberg 03 | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:4 | ||||
| 33. Jornada | 10.05.2025 | FC Carl Zeiss Jena | - | ZFC Meuselwitz | 0:1 | ||||
| 34. Jornada | 18.05.2025 | BSG Chemie Leipzig | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:3 |
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