| 1. Jornada | 29.07.2016 | SV Babelsberg 03 | - | Wacker Nordhausen | 0:2 | ||||
| 2. Jornada | 07.08.2016 | FSV Budissa Bautzen | - | SV Babelsberg 03 | 1:2 |  |
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| 3. Jornada | 10.08.2016 | SV Babelsberg 03 | - | FC Oberlausitz | 5:2 |  |
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| 4. Jornada | 14.08.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | SV Babelsberg 03 | 3:0 | ||||
| 5. Jornada | 27.08.2016 | SV Babelsberg 03 | - | 1. FC Lok Leipzig | 2:0 | ||||
| 9. Jornada | 30.09.2016 | SV Babelsberg 03 | - | FC Schönberg 95 | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 30.10.2016 | Hertha II | - | SV Babelsberg 03 | 2:2 | ||||
| 13. Jornada | 06.11.2016 | SV Babelsberg 03 | - | BFC Dynamo | 1:2 | ||||
| 14. Jornada | 19.11.2016 | Energie Cottbus | - | SV Babelsberg 03 | 3:0 | |
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| 26. Jornada | 02.04.2017 | FC Schönberg 95 | - | SV Babelsberg 03 | 0:1 | ||||
| 29. Jornada | 19.04.2017 | SV Babelsberg 03 | - | Hertha II | 1:3 | ||||
| 33. Jornada | 14.05.2017 | FSV 63 Luckenwalde | - | SV Babelsberg 03 | 1:4 |
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