| 6. Jornada | 24.09.2006 | SV Yesilyurt | - | Hansa Rostock II | 2:1 | ||||
| 7. Jornada | 30.09.2006 | Hansa Rostock II | - | BFC Preussen | 3:2 |  |
|||
| 10. Jornada | 29.10.2006 | FV Motor Eberswalde | - | Hansa Rostock II | 1:6 | ||||
| 12. Jornada | 12.11.2006 | FC Schönberg 95 | - | Hansa Rostock II | 1:2 | ||||
| 13. Jornada | 18.11.2006 | Hansa Rostock II | - | TSG Neustrelitz | 1:2 | ||||
| 14. Jornada | 26.11.2006 | BAK Ankaraspor 07 | - | Hansa Rostock II | 2:0 | ||||
| 16. Jornada | 09.12.2006 | Hansa Rostock II | - | TeBe Berlin | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 03.03.2007 | Hansa Rostock II | - | MSV 1919 Neuruppin | 3:0 | ||||
| 19. Jornada | 10.03.2007 | Germania Schöneiche | - | Hansa Rostock II | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 18.03.2007 | Türkiyemspor Berlin | - | Hansa Rostock II | 0:0 | ||||
| 21. Jornada | 25.03.2007 | Hansa Rostock II | - | SV Yesilyurt | 3:1 | ||||
| 22. Jornada | 01.04.2007 | BFC Preussen | - | Hansa Rostock II | 0:2 | ||||
| 17. Jornada | 09.04.2007 | Torgelower SV Greif | - | Hansa Rostock II | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 14.04.2007 | Hansa Rostock II | - | BFC Dynamo | 3:2 | ||||
| 24. Jornada | 22.04.2007 | Ludwigsfelder FC | - | Hansa Rostock II | 0:1 | ||||
| 25. Jornada | 29.04.2007 | Hansa Rostock II | - | FV Motor Eberswalde | 6:1 |
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