| 1. Jornada | 08.08.2009 | SC Pfullendorf | - | Karlsruher SC II | 1:1 |  |
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| 2. Jornada | 16.08.2009 | Eintracht Frankfurt II | - | SC Pfullendorf | 1:0 |  |
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| 3. Jornada | 21.08.2009 | SC Pfullendorf | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:0 | |
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| 7. Jornada | 11.09.2009 | SC Pfullendorf | - | VfR Aalen | 2:0 | ||||
| 8. Jornada | 18.09.2009 | 1. FC Nürnberg II | - | SC Pfullendorf | 1:0 | ||||
| 10. Jornada | 03.10.2009 | SV Wehen Wiesbaden II | - | SC Pfullendorf | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 16.10.2009 | SC Pfullendorf | - | SpVgg Weiden | 4:3 | |
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| 12. Jornada | 23.10.2009 | TSV 1860 München II | - | SC Pfullendorf | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 30.10.2009 | SC Pfullendorf | - | Darmstadt | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 07.11.2009 | SSV Ulm 1846 | - | SC Pfullendorf | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 20.11.2009 | SC Pfullendorf | - | SG Sonnenhof Großaspach | 3:1 | ||||
| 16. Jornada | 28.11.2009 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SC Pfullendorf | 0:0 | |
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| 18. Jornada | 19.12.2009 | Karlsruher SC II | - | SC Pfullendorf | 3:2 |
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