| 1. Jornada | 15.08.1999 | Hertha | - | Hansa Rostock | 5:2 | ||||
| 4. Jornada | 10.09.1999 | Hansa Rostock | - | SSV Ulm 1846 | 2:1 | ||||
| 5. Jornada | 17.09.1999 | SC Freiburg | - | Hansa Rostock | 5:0 | ||||
| 6. Jornada | 25.09.1999 | Hansa Rostock | - | TSV 1860 München | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 16.10.1999 | Hansa Rostock | - | Eintracht Frankfurt | 3:1 | ||||
| 9. Jornada | 22.10.1999 | Hansa Rostock | - | Arminia Bielefeld | 2:1 |  |
|||
| 10. Jornada | 29.10.1999 | Werder Bremen | - | Hansa Rostock | 2:1 | ||||
| 11. Jornada | 05.11.1999 | Hansa Rostock | - | Hamburgo | 3:3 | ||||
| 13. Jornada | 27.11.1999 | Hansa Rostock | - | SpVgg Unterhaching | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 04.02.2000 | Hansa Rostock | - | Hertha | 0:1 | ||||
| 21. Jornada | 20.02.2000 | SSV Ulm 1846 | - | Hansa Rostock | 1:1 | |
|||
| 22. Jornada | 25.02.2000 | Hansa Rostock | - | SC Freiburg | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 02.04.2000 | Hansa Rostock | - | Werder Bremen | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 07.04.2000 | Hamburgo | - | Hansa Rostock | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 16.04.2000 | SpVgg Unterhaching | - | Hansa Rostock | 1:1 |  |
|||
| 31. Jornada | 22.04.2000 | Hansa Rostock | - | MSV Duisburg | 3:1 | |
|||
| 32. Jornada | 29.04.2000 | Bayern Múnich | - | Hansa Rostock | 4:1 |
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