| 1. Jornada | 03.08.2003 | Colonia | - | Rot-Weiss Essen | 2:2 | ||||
| 2. Jornada | 09.08.2003 | Chemnitzer FC | - | Colonia | 0:0 | ||||
| 3. Jornada | 16.08.2003 | Colonia | - | SC Paderborn 07 | 0:1 | ||||
| 4. Jornada | 24.08.2003 | Schalke II | - | Colonia | 5:2 | ||||
| 5. Jornada | 31.08.2003 | Colonia | - | Borussia Dortmund II | 2:2 | ||||
| 6. Jornada | 07.09.2003 | Sachsen Leipzig | - | Colonia | 1:1 | ||||
| 7. Jornada | 13.09.2003 | Preußen Münster | - | Colonia | 0:4 | ||||
| 8. Jornada | 18.09.2003 | Colonia | - | Werder Bremen II | 2:0 | ||||
| 9. Jornada | 28.09.2003 | VfR Neumünster | - | Colonia | 2:2 | ||||
| 10. Jornada | 04.10.2003 | Colonia | - | KFC Uerdingen 05 | 5:3 |  |
|||
| 11. Jornada | 10.10.2003 | Eintracht Braunschweig | - | Colonia | 2:3 | ||||
| 12. Jornada | 19.10.2003 | Colonia | - | SG Wattenscheid 09 | 0:1 | ||||
| 13. Jornada | 24.10.2003 | FC St. Pauli | - | Colonia | 4:0 | ||||
| 14. Jornada | 31.10.2003 | Colonia | - | Dynamo Dresden | 2:0 | ||||
| 15. Jornada | 08.11.2003 | Wuppertaler SV | - | Colonia | 3:0 | ||||
| 16. Jornada | 16.11.2003 | Colonia | - | Hamburgo II | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 22.11.2003 | Holstein Kiel | - | Colonia | 5:2 | ||||
| 18. Jornada | 29.11.2003 | Rot-Weiss Essen | - | Colonia | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 06.12.2003 | Colonia | - | Chemnitzer FC | 1:2 |
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