| 9. Jornada | 18.09.2022 | Jahn Regensburg | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
| 10. Jornada | 01.10.2022 | FC St. Pauli | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 08.10.2022 | Eintracht Braunschweig | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
| 12. Jornada | 14.10.2022 | FC St. Pauli | - | Hamburgo | 3:0 | ||||
| 13. Jornada | 22.10.2022 | Arminia Bielefeld | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 19.03.2023 | SV Sandhausen | - | FC St. Pauli | 0:5 | ||||
| 26. Jornada | 01.04.2023 | FC St. Pauli | - | Jahn Regensburg | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 29.04.2023 | FC St. Pauli | - | Arminia Bielefeld | 2:1 | ||||
| 31. Jornada | 06.05.2023 | Darmstadt | - | FC St. Pauli | 0:3 | ||||
| 34. Jornada | 28.05.2023 | FC St. Pauli | - | Karlsruher SC | 1:1 |  |
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