| 9. Jornada | 24.10.2008 | SV Babelsberg 03 | - | Hannover II | 1:1 | ||||
| 10. Jornada | 29.10.2008 | Hannover II | - | Hallescher FC | 0:1 | ||||
| 11. Jornada | 01.11.2008 | Hamburgo II | - | Hannover II | 0:3 | ||||
| 13. Jornada | 16.11.2008 | Wolfsburgo II | - | Hannover II | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 21.11.2008 | Hannover II | - | VFC Plauen | 3:2 | ||||
| 15. Jornada | 29.11.2008 | Sachsen Leipzig | - | Hannover II | 0:1 | ||||
| 16. Jornada | 06.12.2008 | Hannover II | - | VfB Lübeck | 0:0 | ||||
| 18. Jornada | 19.12.2008 | 1. FC Magdeburg | - | Hannover II | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 28.03.2009 | Hannover II | - | Hansa Rostock II | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 25.04.2009 | Hallescher FC | - | Hannover II | 0:2 | ||||
| 33. Jornada | 30.05.2009 | VfB Lübeck | - | Hannover II | 3:0 | ||||
| 34. Jornada | 07.06.2009 | Hannover II | - | SV Wilhelmshaven | 2:1 |
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