| 5. Jornada | 18.09.2016 | CFC Hertha 06 | - | FC Mecklenburg Schwerin | 3:0 | ||||
| 6. Jornada | 24.09.2016 | FC Mecklenburg Schwerin | - | Germania Schöneiche | 1:3 | ||||
| 7. Jornada | 01.10.2016 | VSG Altglienicke | - | FC Mecklenburg Schwerin | 5:0 | ||||
| 8. Jornada | 15.10.2016 | FC Mecklenburg Schwerin | - | Optik Rathenow | 1:3 | ||||
| 9. Jornada | 21.10.2016 | Malchower SV 90 | - | FC Mecklenburg Schwerin | 2:5 |  |
|||
| 10. Jornada | 29.10.2016 | FC Mecklenburg Schwerin | - | TeBe Berlin | 2:1 | ||||
| 11. Jornada | 06.11.2016 | Victoria Seelow | - | FC Mecklenburg Schwerin | 1:4 | ||||
| 12. Jornada | 19.11.2016 | FC Mecklenburg Schwerin | - | Hansa Rostock II | 2:2 | ||||
| 15. Jornada | 10.12.2016 | FC Mecklenburg Schwerin | - | 1. FC Frankfurt (Oder) | 2:0 | ||||
| 29. Jornada | 28.05.2017 | FC Mecklenburg Schwerin | - | SV Lichtenberg 47 | 1:1 | ||||
| 30. Jornada | 03.06.2017 | 1. FC Frankfurt (Oder) | - | FC Mecklenburg Schwerin | 3:6 |
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