| 1. Jornada | 16.08.2008 | Darmstadt | - | Karlsruher SC II | 1:4 |  |
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| 2. Jornada | 24.08.2008 | Karlsruher SC II | - | SV Wehen Wiesbaden II | 0:1 | ||||
| 3. Jornada | 31.08.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | Karlsruher SC II | 2:2 | ||||
| 4. Jornada | 13.09.2008 | Karlsruher SC II | - | Viktoria Aschaffenburg | 1:3 | ||||
| 5. Jornada | 21.09.2008 | Karlsruher SC II | - | 1. FC Nürnberg II | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 27.09.2008 | SC Pfullendorf | - | Karlsruher SC II | 3:2 | |
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| 7. Jornada | 05.10.2008 | Karlsruher SC II | - | SSV Ulm 1846 | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 18.10.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | Karlsruher SC II | 2:0 | ||||
| 9. Jornada | 25.10.2008 | Karlsruher SC II | - | TSV 1860 München II | 1:3 | ||||
| 11. Jornada | 02.11.2008 | Karlsruher SC II | - | SC Freiburg II | 0:0 | ||||
| 13. Jornada | 15.11.2008 | Karlsruher SC II | - | Waldhof Mannheim | 2:1 | ||||
| 14. Jornada | 21.11.2008 | Eintracht Frankfurt II | - | Karlsruher SC II | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 13.12.2008 | Karlsruher SC II | - | TSV Großbardorf | 2:1 | |
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| 18. Jornada | 20.12.2008 | Karlsruher SC II | - | Darmstadt | 0:2 |
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