| 3. Jornada | 06.08.2005 | VfB Lübeck | - | Colonia | 4:1 | ||||
| 8. Jornada | 10.09.2005 | Colonia | - | Hertha II | 1:5 | ||||
| 11. Jornada | 24.09.2005 | FC Carl Zeiss Jena | - | Colonia | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 29.10.2005 | Rot-Weiss Essen | - | Colonia | 3:1 |  |
|||
| 17. Jornada | 12.11.2005 | Colonia | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 18. Jornada | 19.11.2005 | Hamburgo II | - | Colonia | 0:1 | ||||
| 20. Jornada | 03.12.2005 | Colonia | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 | ||||
| 21. Jornada | 10.12.2005 | Kickers Emden | - | Colonia | 3:0 | ||||
| 23. Jornada | 11.02.2006 | Fortuna Düsseldorf | - | Colonia | 2:0 | ||||
| 27. Jornada | 11.04.2006 | Hertha II | - | Colonia | 3:1 | ||||
| 32. Jornada | 15.04.2006 | Colonia | - | VfL Osnabrück | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 22.04.2006 | SG Wattenscheid 09 | - | Colonia | 4:2 |  |
|||
| 34. Jornada | 29.04.2006 | Colonia | - | Rot-Weiss Essen | 1:1 | ||||
| 36. Jornada | 12.05.2006 | FC St. Pauli | - | Colonia | 3:1 | |
|||
| 37. Jornada | 20.05.2006 | Colonia | - | Hamburgo II | 0:3 | ||||
| 38. Jornada | 27.05.2006 | Werder Bremen II | - | Colonia | 2:2 |
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