| 13. Jornada | 29.10.2016 | Sportfreunde Lotte | - | Fortuna Köln | 0:1 |  |
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| 15. Jornada | 19.11.2016 | Sportfreunde Lotte | - | SC Paderborn 07 | 6:0 |  |
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| 16. Jornada | 26.11.2016 | VfL Osnabrück | - | Sportfreunde Lotte | 3:0 | ||||
| 17. Jornada | 04.12.2016 | Sportfreunde Lotte | - | MSV Duisburg | 0:2 | |
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| 18. Jornada | 11.12.2016 | Mainz II | - | Sportfreunde Lotte | 0:2 | ||||
| 19. Jornada | 17.12.2016 | Sportfreunde Lotte | - | 1. FC Magdeburg | 1:3 | ||||
| 20. Jornada | 28.01.2017 | Sportfreunde Lotte | - | Werder Bremen II | 1:2 | ||||
| 25. Jornada | 04.03.2017 | Jahn Regensburg | - | Sportfreunde Lotte | 2:0 | |
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| 29. Jornada | 25.03.2017 | FSV Frankfurt | - | Sportfreunde Lotte | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 28.03.2017 | Sportfreunde Lotte | - | Holstein Kiel | 0:0 | ||||
| 30. Jornada | 01.04.2017 | Sportfreunde Lotte | - | VfR Aalen | 0:2 | |
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| 31. Jornada | 05.04.2017 | Preußen Münster | - | Sportfreunde Lotte | 1:0 | ||||
| 32. Jornada | 08.04.2017 | Fortuna Köln | - | Sportfreunde Lotte | 3:0 | ||||
| 34. Jornada | 22.04.2017 | SC Paderborn 07 | - | Sportfreunde Lotte | 3:1 |
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