| 6. Jornada | 29.09.2012 | 1. FC Lok Leipzig | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:0 | ||||
| 1. Jornada | 03.10.2012 | FSV Zwickau | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 07.10.2012 | FC Carl Zeiss Jena | - | Optik Rathenow | 3:0 | ||||
| 10. Jornada | 04.11.2012 | ZFC Meuselwitz | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 09.11.2012 | FC Carl Zeiss Jena | - | VFC Plauen | 0:0 | ||||
| 13. Jornada | 23.11.2012 | FC Carl Zeiss Jena | - | Torgelower SV Greif | 2:1 | ||||
| 14. Jornada | 02.12.2012 | RB Leipzig | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 08.12.2012 | FC Carl Zeiss Jena | - | Energie Cottbus II | 2:0 |  |
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| 17. Jornada | 24.04.2013 | 1. FC Magdeburg | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:1 |
Alemania