| 1. Jornada | 31.08.2008 | Iraklis Saloniki | - | Panserraikos | 1:2 |  |
|||
| 2. Jornada | 13.09.2008 | Panserraikos | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 3. Jornada | 21.09.2008 | Olympiacos | - | Panserraikos | 4:1 | ||||
| 4. Jornada | 27.09.2008 | Panserraikos | - | AE Lárissa | 1:3 |  |
|||
| 5. Jornada | 05.10.2008 | Thrasyvoulos Fylis | - | Panserraikos | 0:1 | |
|||
| 6. Jornada | 18.10.2008 | Panserraikos | - | Asteras Tripolis | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 26.10.2008 | Skoda Xanthi | - | Panserraikos | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 01.11.2008 | Levadiakos | - | Panserraikos | 0:0 |  |
|||
| 10. Jornada | 15.11.2008 | AEK Athen | - | Panserraikos | 0:0 | |
|||
| 11. Jornada | 22.11.2008 | Panserraikos | - | Panthrakikos | 1:2 | |
|||
| 12. Jornada | 30.11.2008 | Aris Saloniki | - | Panserraikos | 2:0 | ||||
| 13. Jornada | 06.12.2008 | Panserraikos | - | Ergotelis | 0:2 | ||||
| 15. Jornada | 20.12.2008 | Panserraikos | - | PAOK Saloniki | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 07.01.2009 | Panserraikos | - | Iraklis Saloniki | 0:0 | |
|||
| 17. Jornada | 10.01.2009 | Panionios GSS | - | Panserraikos | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 17.01.2009 | Panserraikos | - | Olympiacos | 0:1 | ||||
| 22. Jornada | 15.02.2009 | Panserraikos | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 22.03.2009 | Panserraikos | - | Aris Saloniki | 1:2 |
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