| 1. Jornada | 15.08.2008 | SSV Reutlingen | - | SSV Ulm 1846 | 1:2 | ||||
| 2. Jornada | 23.08.2008 | SSV Ulm 1846 | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:0 | ||||
| 3. Jornada | 30.08.2008 | TSV Großbardorf | - | SSV Ulm 1846 | 2:2 | ||||
| 4. Jornada | 13.09.2008 | SSV Ulm 1846 | - | Darmstadt | 1:0 |  |
|||
| 5. Jornada | 20.09.2008 | SV Wehen Wiesbaden II | - | SSV Ulm 1846 | 0:1 | |
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| 6. Jornada | 26.09.2008 | SSV Ulm 1846 | - | SpVgg Unterhaching II | 3:0 | |
|||
| 7. Jornada | 05.10.2008 | Karlsruher SC II | - | SSV Ulm 1846 | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 17.10.2008 | SSV Ulm 1846 | - | 1. FC Nürnberg II | 3:0 | ||||
| 10. Jornada | 29.10.2008 | SSV Ulm 1846 | - | Viktoria Aschaffenburg | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 01.11.2008 | SSV Ulm 1846 | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:2 | |
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| 12. Jornada | 07.11.2008 | TSV 1860 München II | - | SSV Ulm 1846 | 2:2 | ||||
| 13. Jornada | 14.11.2008 | SSV Ulm 1846 | - | Hessen Kassel | 3:1 | ||||
| 14. Jornada | 22.11.2008 | SC Freiburg II | - | SSV Ulm 1846 | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 17.12.2008 | SSV Ulm 1846 | - | Eintracht Frankfurt II | 0:0 |
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