| 18. Jornada | 27.01.2017 | 1. FC Union Berlin | - | VfL Bochum | 2:1 |  |
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| 19. Jornada | 05.02.2017 | Dynamo Dresden | - | 1. FC Union Berlin | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 12.02.2017 | 1. FC Union Berlin | - | Arminia Bielefeld | 3:1 | |
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| 21. Jornada | 19.02.2017 | Karlsruher SC | - | 1. FC Union Berlin | 1:2 | ||||
| 22. Jornada | 24.02.2017 | 1. FC Union Berlin | - | TSV 1860 München | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 03.03.2017 | 1. FC Union Berlin | - | Würzburger Kickers | 2:0 | |
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| 24. Jornada | 10.03.2017 | FC St. Pauli | - | 1. FC Union Berlin | 1:2 | |
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| 25. Jornada | 20.03.2017 | 1. FC Union Berlin | - | 1. FC Nürnberg | 1:0 |  |
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| 26. Jornada | 01.04.2017 | Hannover | - | 1. FC Union Berlin | 2:0 | ||||
| 27. Jornada | 05.04.2017 | 1. FC Union Berlin | - | Erzgebirge Aue | 0:1 | ||||
| 28. Jornada | 09.04.2017 | Fortuna Düsseldorf | - | 1. FC Union Berlin | 2:2 | ||||
| 29. Jornada | 16.04.2017 | 1. FC Union Berlin | - | 1. FC Kaiserslautern | 3:1 | |
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| 30. Jornada | 24.04.2017 | Stuttgart | - | 1. FC Union Berlin | 3:1 | |
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| 31. Jornada | 28.04.2017 | 1. FC Union Berlin | - | SV Sandhausen | 2:1 |  |
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| 34. Jornada | 21.05.2017 | SpVgg Greuther Fürth | - | 1. FC Union Berlin | 1:2 | |
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