| 3. Jornada | 27.08.2006 | FC St. Pauli II | - | FC Oberneuland | 2:1 | ||||
| 9. Jornada | 14.10.2006 | VfR Neumünster | - | FC St. Pauli II | 0:1 | ||||
| 11. Jornada | 29.10.2006 | Eintracht Nordhorn | - | FC St. Pauli II | 5:1 | ||||
| 15. Jornada | 26.11.2006 | Hannover II | - | FC St. Pauli II | 3:1 | ||||
| 22. Jornada | 04.03.2007 | FC St. Pauli II | - | Wolfsburgo II | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 01.04.2007 | Holstein Kiel II | - | FC St. Pauli II | 3:2 |
Croacia