| 18. Jornada | 19.01.2007 | SpVgg Unterhaching | - | Erzgebirge Aue | 1:1 |  |
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| 19. Jornada | 28.01.2007 | MSV Duisburg | - | SpVgg Unterhaching | 4:2 | ||||
| 20. Jornada | 04.02.2007 | SpVgg Unterhaching | - | SC Freiburg | 0:2 | ||||
| 21. Jornada | 09.02.2007 | Augsburgo | - | SpVgg Unterhaching | 2:1 | ||||
| 23. Jornada | 25.02.2007 | 1. FC Kaiserslautern | - | SpVgg Unterhaching | 4:0 | ||||
| 24. Jornada | 02.03.2007 | SpVgg Unterhaching | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:0 |  |
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| 25. Jornada | 11.03.2007 | Colonia | - | SpVgg Unterhaching | 4:1 | |
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| 26. Jornada | 18.03.2007 | SpVgg Unterhaching | - | SC Paderborn 07 | 0:3 | ||||
| 27. Jornada | 30.03.2007 | Wacker Burghausen | - | SpVgg Unterhaching | 4:1 | ||||
| 28. Jornada | 08.04.2007 | SpVgg Unterhaching | - | Eintracht Braunschweig | 3:2 | ||||
| 33. Jornada | 13.05.2007 | SpVgg Unterhaching | - | SpVgg Greuther Fürth | 2:1 | |
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| 34. Jornada | 20.05.2007 | Hansa Rostock | - | SpVgg Unterhaching | 3:1 | |
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