| 3. Jornada | 30.08.2008 | Waldhof Mannheim | - | SC Freiburg II | 3:2 | ||||
| 7. Jornada | 04.10.2008 | TSV Großbardorf | - | SC Freiburg II | 2:0 |  |
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| 8. Jornada | 18.10.2008 | SC Freiburg II | - | Darmstadt | 0:2 | ||||
| 14. Jornada | 22.11.2008 | SC Freiburg II | - | SSV Ulm 1846 | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 06.12.2008 | SC Freiburg II | - | TSV 1860 München II | 1:3 | |
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| 17. Jornada | 13.12.2008 | Hessen Kassel | - | SC Freiburg II | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 28.02.2009 | SC Freiburg II | - | Waldhof Mannheim | 1:0 |  |
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| 22. Jornada | 14.03.2009 | SC Freiburg II | - | SSV Reutlingen | 2:3 |  |
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| 23. Jornada | 21.03.2009 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | SC Freiburg II | 5:1 | |
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| 24. Jornada | 28.03.2009 | SC Freiburg II | - | TSV Großbardorf | 3:0 | ||||
| 25. Jornada | 03.04.2009 | Darmstadt | - | SC Freiburg II | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 26.04.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | SC Freiburg II | 1:4 | ||||
| 31. Jornada | 16.05.2009 | SSV Ulm 1846 | - | SC Freiburg II | 3:1 |
Alemania