| 4. Jornada | 02.08.2016 | SpVgg Unterhaching | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:0 | ||||
| 7. Jornada | 21.08.2016 | SpVgg Greuther Fürth II | - | TSV 1860 München II | 1:2 | ||||
| 9. Jornada | 03.09.2016 | SpVgg Greuther Fürth II | - | VfR Garching | 4:2 |  |
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| 10. Jornada | 09.09.2016 | FC Memmingen | - | SpVgg Greuther Fürth II | 1:1 | |
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| 14. Jornada | 08.10.2016 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SV Schalding-Heining | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 15.10.2016 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 29.10.2016 | FV Illertissen | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 05.11.2016 | SV Seligenporten | - | SpVgg Greuther Fürth II | 3:1 | ||||
| 19. Jornada | 12.11.2016 | SpVgg Greuther Fürth II | - | Wacker Burghausen | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 27.11.2016 | Ingolstadt II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 06.03.2017 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SpVgg Bayreuth | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 25.03.2017 | SpVgg Greuther Fürth II | - | TSV 1860 Rosenheim | 2:2 | ||||
| 27. Jornada | 09.04.2017 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SpVgg Bayern Hof | 4:3 | ||||
| 30. Jornada | 21.04.2017 | TSV Buchbach | - | SpVgg Greuther Fürth II | 1:1 |
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