| 23. Jornada | 26.01.2013 | SV Wehen Wiesbaden | - | SV Babelsberg 03 | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 02.02.2013 | SV Babelsberg 03 | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 2:4 | ||||
| 25. Jornada | 09.02.2013 | Hallescher FC | - | SV Babelsberg 03 | 1:0 | ||||
| 34. Jornada | 20.04.2013 | SV Babelsberg 03 | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 |  |
|||
| 35. Jornada | 27.04.2013 | Stuttgarter Kickers | - | SV Babelsberg 03 | 2:1 | ||||
| 30. Jornada | 30.04.2013 | SV Babelsberg 03 | - | Borussia Dortmund II | 1:1 | ||||
| 36. Jornada | 04.05.2013 | SV Babelsberg 03 | - | SpVgg Unterhaching | 3:1 | ||||
| 37. Jornada | 11.05.2013 | SV Babelsberg 03 | - | Wacker Burghausen | 0:4 |
Alemania