2. Bundesliga   P V E D Goles
  En casa 3 2 1 0 7 : 1
  Fuera de casa 3 2 0 1 4 : 3
  6 4 1 1 11 : 4
DFB-Pokal   P V E D Goles
  Fuera de casa 1 1 0 0 3 : 2
  1 1 0 0 3 : 2
Regionalliga Nord   P V E D Goles
  En casa 1 1 0 0 2 : 0
  Fuera de casa 1 0 1 0 1 : 1
  2 1 1 0 3 : 1
Total   P V E D Goles
  En casa 4 3 1 0 9 : 1
  Fuera de casa 5 3 1 1 8 : 6
  En campo neutral 0 0 0 0 0 : 0
  9 6 2 1 17 : 7
2. Bundesliga
2023/2024 21. Jornada 1. FC Magdeburg - FC St. Pauli 1:0 (0:0)
2023/2024 4. Jornada FC St. Pauli - 1. FC Magdeburg 0:0 (0:0)
2022/2023 21. Jornada 1. FC Magdeburg - FC St. Pauli 1:2 (1:0)
2022/2023 4. Jornada FC St. Pauli - 1. FC Magdeburg 3:0 (2:0)
2018/2019 18. Jornada FC St. Pauli - 1. FC Magdeburg 4:1 (1:1)
2018/2019 1. Jornada 1. FC Magdeburg - FC St. Pauli 1:2 (1:1)
DFB-Pokal
2021/2022 Primera ronda 1. FC Magdeburg - FC St. Pauli 2:3 (1:2)
Regionalliga Nord
2006/2007 38. Jornada 1. FC Magdeburg - FC St. Pauli 1:1 (0:0)
2006/2007 19. Jornada FC St. Pauli - 1. FC Magdeburg 2:0 (2:0)

En el caso de que un partido se haya decidido en tanda de penaltis, en este historial encuentras el resultado tras 120 minutos jugados.